Miniconda
1. Introdução
O miniconda ajuda bastante na hora de instalar um programa porque ele resolve todas as dependências de forma que o usuário não precise ficar quebrando a cabeça na hora da instalação.
A criação de um ambiente virtual facilita porque caso seja feita alguma instalação de programa e ele passe por alguma instabilidade, basta remover o ambiente virtual e criar um novo sem danificar o sistema operacional.
2. Instalação do miniconda no Linux por meio do site oficial
3. Baixar o instalador
Digitar no seu terminal Linux o comando:
wget https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
Executar o instalador
bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
Basta aceitar todas as opções que vão aparecendo no processo de instalação.
Após a instalação é necessário reiniciar o terminal do Linux para que as mudanças sejam aplicadas.
Após reiniciar o terminal, ele ficará assim:
(base) guilherme@DESKTOP-LD7TCRV:~$
Note o nome (base) na frente do nome do usuário.
4. Para atualizar o conda
conda update -n base -c defaults conda
5. Criar um novo ambiente virtual
conda create --name <nome_ambiente>
Exemplo: Criação do ambiente virtual chamado inpe.
conda create --name inpe
6. Ver a lista de programas instalados
conda list
7. Desativar um ambiente virtual
conda deactivate
Ao fazer isso, o usuário sairá do ambiente virtual corrente e mudará para o ambiente virtual (base).
8. Ativar um ambiente
conda activate <nome_ambiente>
Exemplo:
conda activate inpe
Antes o ambiente era o (base).
(base) guilherme@DESKTOP-LD7TCRV:~$
Após o comando, ficará assim:
(inpe) guilherme@DESKTOP-LD7TCRV:~$
9. Remover um ambiente
conda env remove --name <nome_ambiente>
Exemplo:
conda env remove --name inpe
10. Instalação de programas
A descrição abaixo é um exemplo de procura e instalação do programa CDO.
Caso seja necessário instalar um programa, mas não se sabe como fazê-lo, basta pesquisar no google, por exemplo, cdo instalação conda. Ao clicar na imagem abaixo:
OBS: A instalação é feita considerando sempre a versão mais recente do programa.
Aparecerá a imagem abaixo, basta copiar e colar a primeira linha da imagem no terminal do Linux, ou seja:
conda install -c conda-forge cdo
10.1 Instalação do NCL
conda install -c conda-forge ncl
10.2 Instalação do gdal
conda install -c conda-forge gdal
10.3 Instalação do CDO
conda install -c conda-forge cdo
10.4 Instalação do imagemagick
conda install -c conda-forge imagemagick
10.5 Instalação do ncview
conda install -c conda-forge ncview
10.6 Instalação do htop
conda install -c conda-forge htop
10.7 Instalação do parallel
conda install -c conda-forge parallel
10.8 Instalação do nco
conda install -c conda-forge nco
10.9 Instalação do wgrib2
conda install -c conda-forge wgrib2
Ao executar o wgrib2 e aparecer o erro abaixo:
wgrib2: error while loading shared libraries: libjasper.so.1: cannot open shared object file: No such file or directory
Basta criar um link simbólico de acordo com o comando abaixo. Tudo isso é uma linha. Altere os caminhos de acordo com o seu usuário (queimadas) e ambiente virtual (risco_fogo):
ln -s /home/queimadas/miniconda3/envs/risco_fogo/lib/libjasper.so.4 /home/queimadas/miniconda3/envs/risco_fogo/lib/libjasper.so.1
Onde: /home/queimadas/miniconda3/envs/risco_fogo/lib/libjasper.so.4 representa a biblioteca que está no computador.
E /home/queimadas/miniconda3/envs/risco_fogo/lib/libjasper.so.1 representa o link simbólico que será a biblioteca a ser criada no seu computador, a que foi mostrada no erro.
Outro possível erro que pode aparecer:
wgrib2: error while loading shared libraries: libnetcdf.so.13: cannot open shared object file: No such file or directory
Basta criar um link simbólico de acordo com o comando abaixo. Tudo isso é uma linha. Altere os caminhos de acordo com o seu usuário (queimadas) e ambiente virtual (risco_fogo):
ln -s /home/queimadas/miniconda3/envs/risco_fogo/lib/libnetcdf.so.19 /home/queimadas/miniconda3/envs/risco_fogo/lib/libnetcdf.so.13
Onde: /home/queimadas/miniconda3/envs/risco_fogo/lib/libnetcdf.so.19 representa a biblioteca que está no computador.
E /home/queimadas/miniconda3/envs/risco_fogo/lib/libnetcdf.so.13 representa o link simbólico que será a biblioteca criada, a que foi mostrada no erro.
10.10 Instalação do netcdf4
conda install -c conda-forge netCDF4
10.11 Instalação de uma versão específica de um programa
conda install <nome_programa>==<versão_programa>
Exemplo: Instalar a versão do cdo 1.9.9.
conda install cdo==1.9.9
11. Para atualizar um pacote
conda update <nome_pacote>
Exemplo:
conda update cdo
12. Desinstalar pacote
conda remove <nome_pacote>
Caso não funcione, pode-se usar o --force para forçar a desinstalação:
conda remove --force <nome_pacote>
Exemplo: Desinstalar o cdo.
conda remove cdo
E para forçar a desinstalação do CDO caso o comando acima não funcione:
conda remove --force cdo